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(S)-N-Fmoc-2-噻吩丙氨酸
[CAS 130309-35-2]

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基本信息
产品分类生物化工 >> 氨基酸及其衍生物 >> 丙氨酸类衍生物
产品名称(S)-N-Fmoc-2-噻吩丙氨酸
英文名(S)-N-Fmoc-2-Thienylalanine
别名N-(9-Fluorenylmethoxycarbonyl)-2-thienyl-L-alanine
分子结构(S)-N-Fmoc-2-噻吩丙氨酸分子结构 (CAS 130309-35-2)
分子式C22H19NO4S
分子量393.45
蛋白质序列X
CAS 登录号130309-35-2
EC 号码623-277-5
分子行输入简码
SMILES
C1=CC=C2C(=C1)C(C3=CC=CC=C32)COC(=O)N[C@@H](CC4=CC=CS4)C(=O)O
物理化学性质
密度1.3±0.1 g/cm3 计算值*
熔点218.5 °C (实验值)
沸点623.4±55.0 °C 760 mmHg (计算值)*
闪点330.8±31.5 °C (计算值)*
溶解度1 mM in 2 mL DMF (实验值)
折射率1.65 (计算值)*
*使用计算机软件 Advanced Chemistry Development (ACD/Labs) Software.
安全数据
危险品标志symbol   GHS07 警告  说明
危害标签H302-H315-H319-H335  说明
防护标签P261-P305+P351+P338  说明
危害分类
up    说明
危害分类类别码危害标签
对水生环境长期有害Aquatic Chronic4H413
SDS化学品安全技术说明书参考文本
up chemBlink 化学品故事
把苯环换成含硫芳香环,可以将熟悉的氨基酸骨架变成有用的实验变体。(S)-N-Fmoc-2-噻吩丙氨酸(CAS 130309-35-2)以适合肽组装的形式提供了这一变化。它的意义不限于连接肽链,也与研究芳香侧链如何影响多肽自组织有关。

其氨基酸核心是 3-(噻吩-2-基)-L-丙氨酸:一个亚甲基连接 α-碳与五元噻吩环,连接点位于环的 2 位。它仍是 α-氨基酸,名称中的噻吩丙氨酸并不表示氨基移到了 β-碳。Fmoc 保护 α-氨基,羧基则可用于偶联。

这里的硫位于芳香环中,既不是游离巯基,也不是二硫键中的硫。因此,不能因为同样含硫,就把半胱氨酸常见的巯基反应性赋予含噻吩残基。该环改变侧链的电子分布、形状与可极化性,同时保留可参与分子间堆积的芳香表面。

苯丙氨酸提供了有用对照,因为它也通过亚甲基连接芳香环。但噻吩并不是换了名称的苯,二者的环尺寸与原子类型不同。因此,这一替换可用于考察肽的哪些特征依赖具体芳香基团,而不必假定两者在任何序列中都功能等同。

2010 年,Ian Hamley 等人研究了含噻吩丙氨酸单元的设计淀粉样相关肽,以来源于淀粉样肽设计基序的序列为基础,在不同溶剂中考察自组装。这证明的是较大肽分子中所引入残基的研究用途,不是证明孤立的 Fmoc 保护原料本身形成相同结构,更不是证明它导致淀粉样疾病。

自组装关注许多肽分子如何通过非共价作用聚集;肽合成则关注氨基酸单元最初如何通过共价键连接。必须先制备并表征确定序列,才能解释其聚集行为。临时 Fmoc 属于合成阶段,如果保留,它自身的芳香结构还可能额外影响结果,因此需要将两个阶段区分。

所得组装体不只取决于一种侧链。序列顺序、浓度、溶剂及周围化学条件都会影响分子间结合。某一含噻吩丙氨酸序列的结果,不能成为所有使用该砌块的肽的普遍材料性质。还需要结构测量,区分有序组装与仅仅出现溶液浑浊。

组装纤维还应与新聚合的链区分。在非共价组装中,许多已合成肽分子相互结合,并不必然在彼此之间形成新的主链键。聚集体可以增大,而各组成分子仍保留原序列。这使超分子组织区别于通过另一次偶联来延长肽链。

这一例子说明,非天然氨基酸即使不是药物,也具有科学价值。它允许研究者保留多肽框架的大部分,同时改变可辨识的结构特征。在这里,含硫芳香环成为探索分子堆积与超分子组织的工具。受保护试剂用于实现受控变化,组装后的肽才是需要测量行为的对象。

参考文献:
1. Bachem. Fmoc-beta-(2-thienyl)-Ala-OH, product 4009752; CAS 130309-35-2. https://shop.bachem.com/product/4009752/
2. Hamley IW et al. Self-assembly of a designed amyloid peptide containing the functional thienylalanine unit. Journal of Physical Chemistry B (2010). https://doi.org/10.1021/jp105508g

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